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采用離子交換柱，相當于將柱內離子交換樹脂分多批次與溶液進行交換反應，交換后的溶液及時和離子交換樹脂分離。流過離子交換樹脂床的溶液成分隨時間和床高度變化。此種方法，廣泛應用于生產。

體外再生混床：適合小流量、對環保有嚴格要求的企業。但由于體外再生式混床配套設備多，操作復雜，已很少使用。體內再生混床：適合大流量，有專門的水處理操作人員及廢水處理的場合。體內再生混床在運行及整個再生過程均在混床內進行，再生時樹脂不移出設備以外，且陽、陰樹脂同時再生，因此所需附屬設備少，操作簡便。

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洗脫

當交換完畢之后，一般用蒸餾水洗去殘存溶液，然后用適當的洗脫液進行洗脫。在洗脫過程中、上層被交換的離子先被洗脫下來，經過下層未被交換的樹脂時，又可以再度被交換。因此洗脫液中被交換離子的濃度等于零，隨著洗脫的進行，洗出液離子濃度逐漸增大，達到之后又逐漸減小，至完全洗脫之后，被洗出之離子濃度又等于零。

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混合離子交換柱(混床)：將陽、陰床尚未交換的剩余鹽類進一步除去，由于通過混合離子交換后進入水中的H+和OH-立即生成電離度很低(H2O)，幾乎不存在陽床或陰床交換時產生的逆交換現象，使交換反應進行得十分徹底，因而混合床的出水水質優于陽、陰離子交換柱串聯組成的復床所能達到的水質，能制取純度相當高的成品水。

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由于離子交換層析法分辨率高，工作容量大，并容易操作，因此它不但在、化工、食品等領域成

為獨立的操作單元，也已成為蛋白質、多肽、核酸及大部分發酵產物分離純化的一種重要的方法。目前，在生化分離中約有75%的工藝采用離子交換層析法